1、使用注射用重组人尿激酶原的最常见不良反应是出血。与溶栓相关的出血反应分为两种：
（1）皮肤表面出血或在穿刺部位出血。
（2）内出血，常见为胃肠道、泌尿生殖道、后腹膜、中枢神经系统或实质器官出血。
2、注射用重组人尿激酶原的临床研究表明，只有少部分病人出现瘀斑，鼻衄和齿龈出血，但不需要特殊治疗。胃肠道，泌尿生殖器或腹膜后腔出血极少，罕有报告颅内出血。
3、如果出现明显内脏出血、尤其是脑出血时，应该停止溶栓治疗。rhPro-UK是一种对纤维蛋白有选择的溶栓药物，因此对凝血系统影响轻微，一般不用给予凝血因子。
4、使用注射用重组人尿激酶原一般不会引起过敏反应。如发生过敏反应，应停止滴注并给予相应的治疗。
5、偶见心律失常，可用标准抗-心律失常措施处理。
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