1、过敏反应：较为常见,包括皮疹、药物热、哮喘等，偶可能引起过敏性休克。
2、消化道反应：包括恶心、呕吐、腹泻等反应，偶见伪膜性肠炎。
3、肝毒型：少数患者用药后出现ALT、AST增高，也有致急性肝脏胆汁淤积的报道。
4、肾毒型：偶有急性间质性肾炎的报道。
5、神经系统反应：大剂量静脉注射氟氯西林可引起头痛、抽搐、惊厥等神经系统反应，此反应尤易见于肾功能减退患者。偶有兴奋、焦虑或失眠的报道。
6、血液系统反应：偶有中性粒细胞减少、嗜酸性粒细胞增多、血小板减少或溶血性贫血的报道。
7、长期、大剂量用药可致菌群失调，出现由念球菌或耐药菌引起的二重感染。
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