1.头孢丙烯的不良反应与其他口服头孢菌素相似，主要为胃肠道反应，包括腹泻，恶心，呕吐和腹痛等。亦可发生过敏反应，常见为皮疹、荨麻疹。儿童发生过敏发应较成人多见，多在开始治疗后几天内出现，停药后几天内消失。
其他不良发应较少，包括：肝胆系统AST（谷草转氨酶）和ALT（谷丙转氨酶）升高。偶见碱性磷酸酶和胆红素升高。胆汁淤积性黄痕罕见。
中枢神经系统：眩晕、多动、头痛，精神紧张、失眠。偶见嗜睡。所有这些反应均呈可逆性。
血液系统：白细胞减少、嗜酸性粒细胞增多。
肾脏：血尿素氮增高，血肌酐增高。
其他：尿布皮炎样皮疹和二重感染，生殖器瘙痒和阴道炎。
下述不良事件，无论是否已明确与头孢丙烯的因果关系，在上市后监测中均少见。包括过敏、血管神经性水肿、结肠炎、（包括伪膜结肠炎）、多形性红斑、发热、血清病样反应、Stevens-Johnson综合征和血小板减少症。
2.头孢菌素类药物的不良反应
除上述所列使用头孢丙烯发生的不良反应外，头孢菌素类药物尚有以下的不良反应和实验室检查异常：
再生障碍性贫血、溶血性贫血、出血、肾功能不全、中毒性表皮坏死、中毒性肾病、凝血酶原时间延长、Coomb试验阳性、LDH增高、全血细胞减少、中性粒细胞减少、粒细胞缺乏症。
有几种头孢菌素药物与癫痫发作用关，特别是肾功能损伤患者未减少用药时（见“剂量和用法”）。如与药物治疗有关的癫痫发作，应停用药物，并根据临床表现进行抗惊厥治疗。
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