奥曲肽的主要不良反应包括局部和胃肠道反应。
局部反应 ：对奥曲肽的局部反应包括疼痛或注射部位的针刺、麻刺或烧灼感，可伴有红肿。这些作用极少持续15分钟以上，而且可以采取注射前让药液达到室温或减少溶剂用量提高药物浓度的方法来减轻局部不适。
全身反应 ：
罕见反应 ：皮肤过敏反应，暂时性脱发。有过敏反应发生的个别报道。
心血管系统 ：心动过缓偶有发生。
胃肠道系统 ：食欲不振、恶心、呕吐、痉挛性腹痛，腹胀、胀气、稀便、腹泻和脂肪痢等。虽然大便中脂肪排出会增多，但并无证据表明长期使用奥曲肽会造成吸收不良而导致营养不良。罕见病例中，胃肠道副作用可类似急性肠梗阻伴进行性严重上腹痛、腹部触痛、肌紧张和腹胀。尽量延长用药和吃饭的时间间隔，即在两餐之间或睡觉前用药，会减轻胃肠道副反应的发生。
胆囊 ：长期使用奥曲肽可能引起胆石形成（参见“注意事项” ）。
胰腺 ：由于奥曲肽对生长激素，胰高糖素和胰岛素分泌的抑制作用，故可能造成血糖调节的紊乱。由于餐后糖耐量受影响，某些长期治疗的病人会导致持续的高血糖症。
低血糖也有发生。
个别病例发生急性胰腺炎。通常在奥曲肽开始治疗的几个小时或几天内出现，但会随着停药而逐渐消失。长期应用本品且发生胆石的病人也可能出现胰腺炎。
肝脏 ：已有与奥曲肽治疗相关的肝功能不全的个别报道，包括 ：无胆汁郁积的急性肝炎。停药后转氨酶恢复正常 ；缓慢发生的高胆红素血症伴碱性磷酸酶、γ-谷氨酰转移酶增高和转氨酶轻度增高。
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