最常见报告（>1/10）的不良反应为头痛、腹痛、腹泻、恶心、呕吐、丙氨酸氨基转移酶升高、天门冬氨酸氨基转移酶升高、血碱性磷酸酶升高和皮疹。下表为氟康唑治疗过程中观察到的不良反应及其频率：很常见（≥1/10）；常见（≥1/100至<1/10）；少见（≥1/1000至<1/100）；罕见（≥1/10000至<1/1000）；极罕见（<1/10000）；未知（现有资料无法确认）。
1、血液及淋巴系统疾病：
（1）少见：贫血。
（2）罕见：粒细胞缺乏、白细胞减少、血小板减少、中性粒细胞减少。
2、免疫系统疾病：
罕见：过敏反应。
3、代谢与营养疾病：
（1）少见：食欲减退。
（2）高胆固醇血症、高甘油三脂血症、低钾血症。
4、精神性疾病：
少见：嗜睡、失眠。
5、神经系统疾病：
（1）常见：头痛。
（2）少见：痫性发作、感觉异常、头晕、味觉倒错。
（3）罕见：震颤。
6、耳及迷路类疾病：
少见：眩晕。
7、心脏疾病：
罕见：尖端扭转型室性心动过速、QT间期延长。
8、胃肠道疾病：
（1）常见：腹痛、呕吐、腹泻、恶心。
（2）少见：便秘、消化不良、胃肠胀气、口干。
9、肝胆疾病：
（1）常见：丙氨酸氨基转移酶升高、天门冬氨酸氨基转移酶升高、血碱性磷酸酶升高。
（2）少见：胆汁淤积、黄疸、胆红素升高。
（3）罕见：肝功能衰竭、肝细胞坏死、肝炎、肝细胞损害。
10、皮肤及皮下组织疾病：
（1）常见：皮疹。
（2）少见：药疹、荨麻疹、瘙痒、出汗增多。
（3）中毒性表皮坏死松解症、Stevens-Johnson综合征、急性泛发性发疹性脓疱病、脱落性皮炎、血管性水肿、面部水肿、脱发。
11、骨骼肌、结缔组织与骨骼系统疾病：
少见：肌痛。
12、全身疾病及给药部位病情：
少见：疲劳、不适、乏力、发热。
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