将本品溶于100ml的0.9%氯化钠注射液或5%葡萄糖注射液中，最终浓度为5mg/ml，静脉滴注，滴注时间不少于30分钟，用量如下：
1、术前术后预防用药：成人手术前1-2小时静滴1g奥硝唑，术后12小时静滴0.5g，术后24小时静滴0.5g。
2、治疗厌氧菌引起的感染：成人起始剂量为0.5-1g，然后每12小时静滴0.5g连用3-6天。如病人症状改善，建议改用口服制剂。
3、治疗严重阿米巴病：起始剂量为0.5-1g，然后每12小时0.5g，连用3-6天。
4、儿童剂量为每日20-30mg/kg体重，每12小时静滴一次，滴注时间30分钟。
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